2013年，芳根京子加盟了同事務(wù)所前輩筱原涼子主演的 芳根京子
愛情劇《最后的灰姑娘》，在劇中飾演女主角閨蜜的女兒“武內(nèi)咲”，并以演員身份正式出道 ；10月，在優(yōu)香主演的深夜劇《白馬王子 純愛適齡期》里扮演女學(xué)生“北涼子”。2014年8月，在吉高由里子主演的NHK晨間劇《花子與安妮》里扮演女主角花子的摯友“宮本蓮子”（仲間由紀(jì)惠飾）的女兒“宮本富士子” ；9月，首次擔(dān)任主演的銀幕處女作《物置のピアノ》在日本上映 。
2015年6月，芳根京子從1000名以上的應(yīng)募者中脫穎而出，獲得主演TBS電視臺(tái)金十檔校園劇《表參道高中合唱部！》的機(jī)會(huì) ；同年，并憑借該劇獲得第86屆日劇學(xué)院賞最佳女主角 和第1屆電視劇信心獎(jiǎng)最佳新人獎(jiǎng) ；10月，搭檔志尊淳聯(lián)袂出演的漫改愛情電影《前輩和她》在日本上映 。
2016年3月，加盟有村架純主演的月九檔愛情劇《追憶潸然》 ；隨后，在富士電視臺(tái)夏季檔播出的SP特別劇《蒙太奇 三億元事件奇譚》中擔(dān)任女主角 ；4月，芳根京子四度參與NHK晨間劇女主角的甄選，獲得主演晨間劇第95作《別嬪小姐》的機(jī)會(huì) 。
2017年，搭檔中島健人聯(lián)袂出演青春群像電影《心靈想要大聲呼喊》，飾演言語被封印的女高中生“成瀨順” 。出演6月16日播出的TBS日九檔刑偵劇《小小的巨人》 。出演由佐藤祐市執(zhí)導(dǎo)的電影《累》 ，飾演擁有精湛演技卻相貌丑陋的女演員淵累，該片于2018年上映 。
2018年，出演由西島秀俊主演的電影《椿花散落》在日本上映 。主演一月開播富士臺(tái)月九劇《海月姬》 。出演冢本連平導(dǎo)演執(zhí)導(dǎo)新片《今天也是招人嫌的便當(dāng)》 。
2019年，主演北海道電視臺(tái)（HTB）成立50周年的臺(tái)慶劇《請(qǐng)勿轉(zhuǎn)臺(tái)》 ；3月，憑借《深紅累之淵》《椿花散落》獲得第42屆日本電影學(xué)院獎(jiǎng)最佳新人獎(jiǎng) 。出演電影《記憶使者》 和《打瞌睡的磐音》 。出演富士臺(tái)七月開播的火九劇《兩周》 。
2020年1月20日，參演由古館寬治和瀧藤賢一共同主演的電視劇《古瀧兄弟與四苦八苦》播出 。
