1995年，在電影學(xué)院讀書期間，金巧巧接拍了她的第一部電影《罪惡》。劇中的男主角由周里京扮演，金巧巧扮演一個第三者。在大學(xué)期間金巧巧就和潘長江拍攝了她的第一部影視作品《雨天有故事》，在其中扮演了現(xiàn)代純情少女邱紅。
1999年，憑借《走過柳源》中的夏蓮一角，金巧巧還獲得了第十七屆電視金鷹獎最佳女配角的提名。2000年，在電視劇《
春光燦爛豬八戒》扮演了刁鉆任性的二龍女，并在《大眾電視》雜志舉辦的群眾評選“我心中最喜歡的二十名演員”活動中，金巧巧獲得了評委會頒發(fā)的獎杯。
2003年，成立了自己的公司――北京巧巧影視文化傳播有限公司，獨立制作監(jiān)制出品并主演了電視劇《
佳人有約》。
2004年，在電視劇《喜氣洋洋豬八戒》扮演了紅梅傲雪。2005年《太祖秘史》中金巧巧扮演的那齊婭是一個為了心愛的人可以赴湯蹈火的癡情女子。
2006年《
薛仁貴傳奇》中金巧巧扮演了溫淑賢良的渤遼公主。2007年金巧巧首次跨上了話劇舞臺，主演了驚悚片《
下一個就是你》。2008年，金巧巧推出了個人單曲《
巧克力》。
2009年度榮獲“最佳女演員”稱號，同年接拍了尤小剛導(dǎo)演執(zhí)導(dǎo)的《楊貴妃秘史》，金巧巧出演“玉真公主”一角。
2010年出演《
老大的幸福》小南一角，獲得“華鼎獎”觀眾最喜愛女演員“獎。并在《老大的幸?！穭≈邪缪萑芟眿D“小南”。同年出演陳勛奇執(zhí)導(dǎo)，成龍總監(jiān)制的古裝電影《楊門女將》飾演“楊三娘”一角，與張柏芝，鄭佩佩，劉曉慶，任賢齊領(lǐng)銜主演。
2011年出演導(dǎo)演趙鐳執(zhí)導(dǎo)32集古代傳奇電視劇《香山奇緣》飾演女反一“吳貴妃”，與劉曉虎、徐颯、王馥荔、傅藝偉、斯琴高娃等主演。
2012年于正制作的古裝電視劇《
陸貞傳奇》中巧巧不再飾演“公主”卻演起了“女官”杜司儀，劇中扮演的是女主角陸貞的師傅，由趙麗穎、陳曉、劉雪華、張可頤、楊蓉、喬任梁等主演。
2013年出演彭氏兄弟華語首部災(zāi)難電影《逃出生天3D》劇中和香港演員張兆輝飾演一對夫妻，由古天樂，劉青云，李心潔，張兆輝等主演。
2015年，在當代都市情感大戲《繼父難當》中飾演羅大佐（林永健飾）老板韓玉萍。
